Škola byla zřízena na základě zákona č. 564/1990 Sb. jako příspěvková organizace od 1.1.1995. Předmětem její hlavní činnosti je výchovná a vzdělávací činnost a další činnosti vymezené Zřizovací listinou. Je zřízena jako příspěvková organizace s právní subjektivitou a zařazena do sítě škol Školským úřadem v Českém Krumlově s účinností od 11.3.1996, č.j. 61/96, ve znění změněného rozhodnutí vydaného MŠMT ČR s účinností od 1.12.2002, č.j. 29 739/02-21. Ředitelem školy je Mgr. Milan Holek.

Škola je organizována jako úplná s devíti ročníky. Počet žáků školy se pohybuje kolem dvou set padesáti. Součástí školy je školní družina (2 oddělení), od 1.9.2000 školní jídelna a od 1.12.2002 též Mateřská škola Vyšší Brod s jídelnou.

Spádový obvod školy tvoří následující obce: Vyšší Brod, Studánky, Drkolná, Těchoráz, Hrudkov I a II, Ostrov - Malšín, Dolní Jílovice, Kyselov, Přízeř a Rožmberk nad Vltavou.

Škola pracuje ve všech ročnících podle školního vzdělávacího programu (ŠVP),

Ve své pedagogické práci škola nabízí výuku cizích jazyků od 3. ročníku (Aj, Nj a Rj) a pokračuje v dlouholeté tradici péče o ekologickou výchovu. Od roku 1996 je zapojena do celostátní sítě ekologicky orientovaných škol. Velká pozornost je věnována i estetické výchově dětí. Jejich práce zdobí prostory školy i jednotlivých tříd. Postupně se dobudovává školní zahrada - jako přírodní zahrada s využitím permakulturních prvků.